La interpretación de Elisabeth Shue en Leaving Las Vegas, junto a Nicolas Cage, le valió una candidatura al Oscar a la mejor actriz. También recibió el premio a la mejor actriz de la Asociación de Críticos de Cine de los Ángeles, de la Asociación de Críticos de Cine de Chicago y de la Sociedad Nacional de Críticos de Cine (EE. UU.), así como nominaciones al premio Independent Spirit, al Globo de Oro y al premio del Gremio de Actores de Cine y Televisión.

Recientemente, Shue ha aparecido en Hamlet 2, del director Andrew Fleming, una irreverente comedia sobre un actor malo convertido en un peor profesor de teatro de instituto que crea y representa un musical, una segunda parte políticamente incorrecta del Hamlet de Shakespeare.

Más recientemente, Shue concluyó el rodaje de Piraña 3D para la productora y distribuidora The Weinstein Company, así como la película independiente Janie Jones, junto a la actriz Abigail Breslin. También ha rodado Don McKay, un original thriller psicológico que protagoniza junto a Thomas Hayden-Church y que está escrito y dirigido por el director de cine independiente Jake Goldberger. Entre los últimos trabajos de Shue se encuentran el éxito de la FOX El escondite (Hide & Seek), que protagoniza junto a Dakota Fanning y Robert DeNiro, y la película independiente Mysterious Skin, del director Gregg Araki, muy aclamada por la crítica. Shue también aparece en Dreamer, junto a Kurt Russell y Dakota Fanning.

Entre sus trabajos se incluyen Karate Kid: El momento de la verdad (The Karate Kid), Aventuras en la gran ciudad (Adventures In Babysitting), Cocktail, Escándalo en el plató (Soapdish), Mucho más que amigos (Radio Inside), The Underneath: Bajos fondos, El Santo (The Saint), Seducción letal (Palmetto), La prima Bette (Cousin Bette), Desmontando a Harry (Deconstructing Harry), Molly y El hombre sin sombra (Hollow Man). Además, Shue ha trabajado en Amy and Isabelle, una producción de Oprah Winfrey, y en la puesta en escena de Broadway de Some Americans Abroad, de Richard Nelson.