Johnathon Schaech se mudó a Los Ángeles y estudió con el legendario Roy London durante cuatro años, hasta que le llegó el papel protagonista en la cinta de Franco Zeffirelli La novicia. A continuación trabajó al lado de Wynona Ryder en Donde reside el amor, de Jocelyn Moorhouse, y en la cinta de culto Maldita generación, de Greg Araki. Tom Hanks le seleccionó para interpretar al líder del grupo The Wonders y protagonizó el thriller Relación mortal junto a Gwyneth Paltrow y Jessica Lange.
A continuación, Schaech apareció en filmes independientes como Splendor, de Greg Araki, y en Welcome to Woop Woop, de Stephen Elliott. También trabajó con Kenneth Branagh en Neighbor’s dog, con Harvey Keitel en Graceland, y con Ray Winstone y Guy Pearce en Woundings. Más tarde interpretó los papeles que daban nombre a las películas Houdini, de Pen Densham, y Judas, de Tom Fontana. Actuó al lado de Christina Applegate en El diario de Suzanne y con Heather Locklear en Angels fall, de Nora Roberts.
Schaech se asoció con su antiguo amigo Richard Chizmar para fundar Chesapeake Films. Ambos han triunfado en adaptaciones a la gran pantalla de novelas de Stephen King y Akiva Goldsman. Schaech se encuentra actualmente adaptando otra obra de Stephen King y preparando la preproducción de Fom a Buick 8. Además, está supervisando la posproducción de la primera producción en solitario de Cesapeake, The Poker Club. Como actor, recientemente apareció en las premiadas cintas independientes Sea of Dreams y Little Chenier. También ha coprotagonizado la película de terror Una noche para morir.