Jon Bernthal es un joven actor muy prometedor que estudió en la Escuela de Arte Teatral de Moscú, en Rusia, donde también jugó al béisbol en la Federación Europea de Béisbol Profesional. Estando en Moscú, Bernthal atrajo la atención del director del Instituto de Formación Teatral Avanzada de la Universidad de Harvard, que le invitó a cursar un Máster en Bellas Artes en dicha universidad, donde se graduó en 2002.
La carrera de Bernthal en el teatro incluye el montaje, escenificado fuera del circuito de Broadway, de “The 5th of July” en el Teatro Signature de Nueva York; el montaje, escenificado fuera del circuito de Broadway, de “La Resistible Ascensión de Arturo Ui”; “Proof”, en la Portland Stage Company y “This Is Our Youth” en el Teatro Studio de Washington. Ha actuado en más de veinte obras en teatros de provincias y fuera del circuito de Broadway, muchas de ellas con su propia compañía teatral, Flovea Floods.
Oliver Stone eligió a Bernthal para el papel de Christopher Amoroso en World Trade Center. Bernthal también protagonizó la película independiente Day Zero e intervino en Cuatro Vidas.
En 2009 podemos verle en The Pacific, la miniserie producida por Tom Hanks y Steven Spielberg para HBO. Ha sido actor habitual de la comedia de situación de la CBS The Class, interpretando a Duncan Carmellon, y artista invitado en How I Met Your Mother, Ley y Orden: Unidad Especial de Víctimas, Boston Legal, Johnny Zero, Ley y Orden, Sin Rastro y CSI: Miami.