Vuelve a reunirse con Kirsten Dunst, James Franco y el director Sam Raimi en Spider-Man 3, la tercera parte de una franquicia que hasta el día de hoy ha recaudado más de 1.600 millones de dólares en todo el mundo.
Consiguiendo en su carrera, éxito comercial como de la crítica, Maguire recientemente protagonizó junto a George Clooney y Cate Blanchett, El Buen Alemán de Steven Soderbergh. Los créditos de Maguire incluyen una aclamada interpretación del jockey Red Pollard en Seabiscuit, Más Allá de la Leyenda de Gary Ross. La épica de carreras de caballos recibió siete nominaciones al Premio de la Academia incluyendo Mejor Película.
Actor desde su infancia, Maguire ha aparecido en numerosos proyectos de cine y televisión como Vida de Este Chico, en la que trabajó junto a Robert DeNiro y Leonardo DiCaprio, y en el cortometraje nominado en 1996 al Premio de la Academia, Duke of Groove de Griffin Dunne, con Kate Capshaw, Uma Thurman y Kiefer Sutherland. En 1997, Maguire continuó con el estreno de Fox Searchlight, La Tormenta de Hielo, dirigida por Ang Lee. La película puso a Maguire en la palestra de la crítica y de los espectadores por su interpretación del joven incomprendido.
Otros créditos de Maguire incluyen la sátira literaria de Woody Allen, Desconstructing Harry, Miedo y Asco en Las Vegas de Terry Gilliam, basada en la novela de Hunter S. Thompson y en 1998 la película de fantasía de New Line, Pleasantville, dirigida por Gary Ross y co protagonizada por Reese Witherspoon. Maguire cimentó su carrera como un actor convincente con papeles como el de Homer Wells en el conmovedor drama de Lasse Hallstrom Las Normas de la Casa de la Sidra (una película nominada a siete Premios de la Academia), el de Jake Roedel en Cabalga con el Diablo de Ang Lee, la historia de un joven explorador Americano que se esfuerza por definirse en un país que está re definiendo su imagen en medio de una revuelta social, y como James Leer en Jóvenes Prodigiosos de Curtis Hanson, en la que Maguire fue protagonista junto a Michael Douglas, haciendo el papel de un estudiante con tendencia a novelar su propia historia familiar.
El primer paso de Maguire como productor fue la adaptación a la gran pantalla de la novela de David Benioff "The 25th Hour" para Walt Disney Company. Esta película aclamada por la crítica fue dirigida por Spike Lee y protagonizada por Ed Norton.
Maguire está desarrollando varios proyectos a través de Maguire Entertainment, entre ellos Tokyo Suckerpunch, una adaptación del escritor Ed Solomon de la novela de Isaac Adamson, que cuenta la historia de un joven columnista que se retrata a sí mismo como un héroe viviendo una versión de novela del Tokio de hoy en día. Maguire es el productor junto a Douglas Wick y Lucy Fisher de Red Wagon Entertainment. También se encuentra en desarrollo la adaptación para la gran pantalla de la novela éxito de ventas de Jonathan Tropper, Everything Changes, que actualmente está escribiendo Dan Futterman (Capote). Maguire la producirá junto a Wendy Finerman para Columbia Pictures. Maguire también producirá Hot Plastic con Radar Pictures y Ted Tally para Focus Features. Basada en la famosa novela de Peter Craig (que está adaptando el guión), Hot Plastic se centra en un padre y su hijo estafadores que se enamoran de la misma mujer.