La historia de Cowboy Bebop nos traslada al año 2071 donde la mayoría la humanidad ya se ha expandido por otros planetas después de que una explosión lunar debastara la Tierra.

Allí un antiguo delicuente, ahora metido a cazarecompensas, Spike Spiegel (Keanu Reeves) viaja de planeta en planeta búscando criminales interestelares a bordo de su nave Bebop.