Nacida en Sherman Oaks, California, y criada en Nueva York, es una actriz versátil que conoció desde pequeña el mundo de la interpretación debido a que su padre, John Aniston, fuera el protagonista de la serie diurna de la NBC Days of Our Lives, y que su padrino fuera el ya difunto Telly Savalas.

Aniston acaba de terminar el rodaje de la comedia romántica The Break Up co-protagonizada por Vince Vaughn que se estrenará en la primavera de 2006. Su último estreno, el thriller Derailed fue co-protagonizada por Clive Owen y se estrenó en EEUU en Noviembre.

Hace poco Aniston terminó la décima y última temporada de la comedia de gran éxito, Friends, donde, en el papel de Rachel Green, formó parte del reparto coral con Courteney Cox-Arquette, Matt LeBlanc, Matthew Perry, David Schwimmer y Lisa Kudrow, para la NBC. Su interpretación de Rachel Green le ha valido dos nominaciones al Emma para Mejor Actriz Secundaria, cuatro premios People's Choice por Mejor Actriz en una serie de comedia, dos nominaciones del Screen Actors Guild por Mejor Actriz en una Comedia, así como nominaciones a los Globos de Oro por Mejor Actriz Secundaria en una comedia, drama o miniseries, y por Mejor Interpretación como Actriz en una serie de comedia. Ganó su primer Emmy en 2002 por Mejor Actriz en una serie de comedia, y ganó su primer Globo de Oro en 2003 por Mejor Interpretación por Actriz Principal en una serie de comedia.
Recientemente recibió su tercera nominación a los Emmy por Mejor Actriz Protagonista en una serie de comedia.

Además del éxito masivo que ha logrado en la pequeña pantalla, Aniston diversifica su carrera con papeles muy distintos en la gran pantalla. Ha protagonizado Along Came Polly una comedia con Ben Stiller, y actuó con Jim Carrey y Morgan Freeman en la comedia de gran éxito de Tom Shadyac, Como Dios. Recientemente, protagonizó la muy aclamada tercera película de Miguel Arteta The Good Girl, con Jake Gyllenhaal, John C. Reilly y Zooey Deschanel, en un papel que le valió una nominación a los premios Independent Spirit. La película se estrenó con una crítica muy entusiasmada en el Festival de Sundance.

Otras películas en la filmografía de Aniston son Rock Star, con Mark Wahlberg y dirigida por Stephen Herek; Ella es única protagonizada por el director Ed Burns y Cameron Diaz; Picture Perfect, con Kevin Bacon y Olympia Dukakis, dirigida por Glenn Gordon Caron; 'Til There Was You, con Jeanne Tripplehorn, Sarah Jessica Parker y Dylan McDermott; y la muy aclamada The Object of My Affection, con Paul Rudd. Sus otras películas son Office Space y Dreams for an Insomniac.

Aniston, de ascendencia griega, pasó un año de su niñez viviendo en Grecia con su familia, pero luego se trasladaron a Nueva York cuando su padre logró hacerse con un papel en el culebrón Love of Life. A los 11 años empezó a actuar cuando entró a formar parte del club de arte dramático en la Escuela de Rudolf Steiner. Su experiencia en esta escuela la hizo desarrollar una pasión por el arte. A sus 11 años, una de las pinturas de Aniston fue seleccionada para participar en una exposición en el Museo Metropolitano de Arte de Nueva York.

Inició su formación profesional como estudiante de arte dramático en el Instituto de Artes Escénicos de Nueva York. Después de diplomarse en 1987, Aniston consiguió papeles en las producciones Off-Broadway como For Dear Life, en el Public Theater de Nueva York y Dancing on Checker's Grave. En 1989, consiguió su primer papel en televisión en la serie Molloy. También ha participado en las series de televisión de The Edge y Ferris Bueller, Herman's Head y como artista invitada en Quantum Leap y Burke's Law.

Actualmente Aniston reside en Nueva York.