Doraemon se embarca en su aventura más ecológica. Al gato robot y sus amigos les espera un mundo mágico sobre las nubes y una difícil misión: salvar la Tierra de un grave peligro.

En Doraemon y el misterio de las nubes, nuestros amigos crean su propio mundo en el cielo. Con la ayuda del bolsillo mágico de Doraemon fabrican una nube gigantesca con un castillo, árboles, un río... ¡incluso tiene coches solares! Durante su viaje con la nube se encuentran a unos seres alienígenas que pretenden destruir la civilización para escarmentar a los humanos por su falta de compromiso con el medio ambiente. Doraemon y toda la pandilla deberán buscar aliados y convencer a los habitantes de las nubes de que en la Tierra también hay gente que lucha por la naturaleza. En su aventura, conocerán a buenos amigos, sortearán infinidad de peligros, se toparán con animales prehistóricos y lo darán todo por defender nuestro planeta.