Jesse Eisenberg, en los últimos tiempos, ha protagonizado junto a Kristen Stewart la película de Miramax de Greg Mottola, Adventureland. Por su papel en Roger Dodger, Eisenberg fue nombrado el joven actor más prometedor en el Festival de Cine de San Diego. Fue nominado como mejor actor secundario en el Independent Spirit Awards, y también fue nominado a mejor joven actor en los premios de la Crítica por su trabajo en Una historia de Brooklyn (The Squid and the Whale). Entre otros de sus trabajos se incluyen flimes como El bosque (The Village), The Emperor’s Club, La maldición (Cursed) y La sombra del cazador (The Hunting Party). Recientemente acaba de finalizar el rodaje en Holy Rollers, basado sobre la historia verdadera de un judío tradicional traficante de éxtasis.

En el escenario, la aparición más reciente de Eisenberg ha sido en "Scarcity" del Atlantic Theater Company y previamente protagonizó junto a Al Pacino "Orphans" de Lyle Kessler.