Junto a Chad Hugo forman el proyecto N*E*R*D, aunque son más conocidos por su faceta como productores con la que firman bajo el nombre de The Neptunes (Britney Spears, *NSync)... En este proyecto están acompañados de un vocalista, Shay. Dejando atrás la parte más edulcorada del r&b pero manteniendo su capacidad para crear auténticos hits con su explosiva mezcla de pop, rock clásico, psicodelia... Después de captar la atención de prensa y público con su álbum de debut In Search Of... (2002), en el 2004 aparece en el mercado su segundo disco Fly or Die.

Pharrell Williams publica su esperado disco en solitario en 2006, In My Mind.